Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk11bP24788 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms