Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms