Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Znf239P24399 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms