Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms