Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PparaP23204 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PparaP23204 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PparaP23204 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PparaP23204 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PparaP23204 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PparaP23204 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PparaP23204 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PparaP23204 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PparaP23204 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PparaP23204 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms