Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms