Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcb4P21440 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb4P21440 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms