Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms