Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms