Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P20040 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P20040 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P20040 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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