Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms