Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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