Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp53P15975 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms