Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms