Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116 ms