Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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DmdP11531 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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DmdP11531 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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DmdP11531 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DmdP11531 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DmdP11531 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DmdP11531 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DmdP11531 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DmdP11531 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DmdP11531 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DmdP11531 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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DmdP11531 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DmdP11531 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DmdP11531 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DmdP11531 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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DmdP11531 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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