Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Defa1P11477 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Defa1P11477 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Defa1P11477 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Defa1P11477 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Defa1P11477 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa1P11477 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Defa1P11477 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Defa1P11477 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Defa1P11477 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Defa1P11477 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Defa1P11477 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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