Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms