Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf1P09925 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms