Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms