Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TnfP06804 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnfP06804 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms