Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P04214 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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P04214 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P04214 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P04214 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P04214 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P04214 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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P04214 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P04214 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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P04214 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P04214 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P04214 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P04214 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P04214 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P04214 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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P04214 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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