Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HbaP01942 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HbaP01942 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HbaP01942 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HbaP01942 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HbaP01942 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HbaP01942 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HbaP01942 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HbaP01942 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HbaP01942 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HbaP01942 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HbaP01942 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HbaP01942 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HbaP01942 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HbaP01942 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HbaP01942 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HbaP01942 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HbaP01942 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HbaP01942 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HbaP01942 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms