Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01878 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01878 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01878 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01878 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01878 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01878 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01878 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01878 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01878 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01878 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01878 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01878 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01878 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01878 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01878 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms