Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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Ccl20O89093 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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Ccl20O89093 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccl20O89093 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccl20O89093 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccl20O89093 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccl20O89093 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccl20O89093 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ccl20O89093 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ccl20O89093 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ccl20O89093 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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