Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col5a1O88207 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a1O88207 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a1O88207 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a1O88207 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a1O88207 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a1O88207 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a1O88207 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a1O88207 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a1O88207 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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