Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms