Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms