Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sdc4O35988 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sdc4O35988 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sdc4O35988 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sdc4O35988 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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