Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaluO35887 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaluO35887 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaluO35887 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CaluO35887 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CaluO35887 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CaluO35887 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CaluO35887 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CaluO35887 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CaluO35887 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms