Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk2O35491 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Clk2O35491 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms