Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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TnxbO35452 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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TnxbO35452 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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TnxbO35452 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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TnxbO35452 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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TnxbO35452 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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TnxbO35452 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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TnxbO35452 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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TnxbO35452 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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TnxbO35452 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TnxbO35452 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TnxbO35452 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TnxbO35452 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms