Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Kpna4O35343 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Kpna4O35343 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Kpna4O35343 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Kpna4O35343 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kpna4O35343 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms