Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms