Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms