Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efna5O08543 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna5O08543 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms