Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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