Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm3278L7N2D2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm3278L7N2D2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm3278L7N2D2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm3278L7N2D2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm3278L7N2D2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm3278L7N2D2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm3278L7N2D2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm3278L7N2D2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms