Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm8298J3QPI0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8298J3QPI0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm8298J3QPI0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8298J3QPI0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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