Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms