Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Gm21976J3QNN2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Gm21976J3QNN2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Gm21976J3QNN2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21976J3QNN2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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