Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20828J3KMI7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Gm20828J3KMI7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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