Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Taf4bG5E8Z2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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