Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4aF8VPX6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Speer4aF8VPX6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms