Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms