Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
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Zfp988F6VKC7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Zfp988F6VKC7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Zfp988F6VKC7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Zfp988F6VKC7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Zfp988F6VKC7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Zfp988F6VKC7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms