Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms