Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BC067074F6RXI4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BC067074F6RXI4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms