Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzd7E9Q9W7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms