Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Urb2E9Q7L1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms